Biopsym : a learning environment for transrectal ultrasound guided prostate biopsies

This paper describes a learning environment for image-guided prostate biopsies in cancer diagnosis; it is based on an ultrasound probe simulator virtually exploring real datasets obtained from patients. The aim is to make the training of young physicians easier and faster with a tool that combines lectures, biopsy simulations and recommended exercises to master this medical gesture. It will particularly help acquiring the three-dimensional representation of the prostate needed for practicing biopsy sequences. The simulator uses a haptic feedback to compute the position of the virtual probe from three-dimensional (3D) ultrasound recorded data. This paper presents the current version of this learning environment

BiopSym: a simulator for enhanced learning of ultrasound-guided prostate biopsy

This paper describes a simulator of ultrasound-guided prostate biopsies for cancer diagnosis. When performing biopsy series, the clinician has to move the ultrasound probe and to mentally integrate the real-time bi-dimensional images into a three-dimensional (3D) representation of the anatomical environment. Such a 3D representation is necessary to sample regularly the prostate in order to maximize the probability of detecting a cancer if any. To make the training of young physicians easier and faster we developed a simulator that combines images computed from three-dimensional ultrasound recorded data to haptic feedback. The paper presents the first version of this simulator

Estimation of urinary stone composition by automated processing of CT images

The objective of this article was developing an automated tool for routine clinical practice to estimate urinary stone composition from CT images based on the density of all constituent voxels. A total of 118 stones for which the composition had been determined by infrared spectroscopy were placed in a helical CT scanner. A standard acquisition, low-dose and high-dose acquisitions were performed. All voxels constituting each stone were automatically selected. A dissimilarity index evaluating variations of density around each voxel was created in order to minimize partial volume effects: stone composition was established on the basis of voxel density of homogeneous zones. Stone composition was determined in 52% of cases. Sensitivities for each compound were: uric acid: 65%, struvite: 19%, cystine: 78%, carbapatite: 33.5%, calcium oxalate dihydrate: 57%, calcium oxalate monohydrate: 66.5%, brushite: 75%. Low-dose acquisition did not lower the performances (P < 0.05). This entirely automated approach eliminates manual intervention on the images by the radiologist while providing identical performances including for low-dose protocols

Peripapillary retinal nerve fiber layer thickness longitudinal changes and associated factors in an elderly population: the alienor study

Objectifs : Étudier en imagerie par cohérence optique spectral-domain (OCT-SD) les changements intéressant l’épaisseur des fibres nerveuses rétiniennes péripapillaires (RNFL) au cours du temps et les facteurs de risques associés. Dans cette étude de population, 624 habitants de Bordeaux, France, âgés de 73 ans ou plus ont été inclus dans l’étude ALIENOR (Antioxydants, Lipides Essentiels, Nutrition et Maladies Oculaires) entre Avril 2009 et Mai 2017. Un examen clinique et ophtalmologique étaient réalisés tous les 2 ans. Les mesures des épaisseurs du RNFL global et sectoriels étaient obtenues en imageries OCT-SD à l’aide d’un anneau de 3.45 mm centré sur la papille optique. L’étude des facteurs de risques associés a été réalisée en analyse multivariée. Résultats : Le suivi moyen était de 5.2±1.8 ans. Le taux moyen de perte d’épaisseur du RNFL était de -0.68 μm ± 0.06 par an pour le RNFL global et était plus important pour les secteurs supéro-temporal et inféro-temporal (-1.02μm ± 0.11 et -1.15μm ± 0.10 respectivement), suivi par les secteurs inféro-nasal (-0.82μm ± 0.08), supéro-nasal (-0.62μm ± 0.09), temporal (-0.52μm ±0.08) et nasal (-0.25μm ± 0.07). Un HDL-cholestérol plasmatique élevé (>1.03 mmol/l chez les hommes ; >1.29 mmol/l chez les femmes) et la prise de Statines hydrosolubles étaient significativement associés à une diminution moindre du RNFL au cours du temps (Bêta = 0.33, p=0,041) et (Bêta = 0,58, p=0.0046), respectivement. Cette étude confirme qu’il existe une perte en épaisseur du RNFL avec l’âge avec un HDL-cholestérol plasmatique élevé et la prise de Statines hydrosolubles agissant comme facteurs protecteurs de cet amincissement. Les modifications liés à l’âge sur le RNFL péripapillaire doivent être prises en compte lors de l’étude en OCT des pathologies touchant la tête du nerf optique.Objectives: To investigate the peripapillary retinal nerve fiber layer thickness (RNFLT) age- related changes and associated factors using spectral-domain optical coherence tomography (SD-OCT). In this population-based cohort study, 624 residents of Bordeaux, France, aged 73 years or older at baseline were included in the Antioxydants, Lipides Essentiels, Nutrition et Maladies Oculaires (ALIENOR) Study between April 2009, and May 2017 wand underwent a clinical and ophthalmological examination every two years. Mean global and sectorial RNFLT values were obtained using SD-OCT and a 3.45mm circle scan diameter centered on the optic disc. Association of ophthalmological and clinical factors with RNFL changes were performed in a multivariate analysis. Results: The mean follow-up duration was 5.2 ± 1.8 years. The mean rate of RNFLT loss per year was -0.68 μm ± 0.06 per year for global and was higher in superotemporal and inferotemporal sectors (-1.02μm ± 0.11 and -1.15μm ± 0.10 respectively), followed by inferonasal (-0.82μm ± 0.08), superonasal (-0.62μm ± 0.09), temporal (-0.52μm ± 0.08) and nasal sectors (-0.25μm ± 0.07). High plasma HDL-cholesterol (>1.03 mmol/l in men; >1.29 mmol/l in women) and the use of hydrophilic statins had a positive association with longitudinal pRNFLT (Bêta = 0.33, p=0,041) and (Bêta = 0,58, p=0.0046), respectively. This study confirms that peripapillary RNFL thickness decreases with increasing age. High plasma HDL-cholesterol and hydrophilic statins use have a protective effect on RNFLT changes over time. Age-related changes should be taken into consideration when interpreting RNFLT values using SD-OCT to assess the diagnosis or the progression of optic nerve head diseases

Détermination d'un indice de dissimilarité pour l'estimation tomodensitométrique automatique de la composition des calculs urinaires (étude in vitro et in vivo)

Nous avons mis au point une méthode automatique et innovante déterminant la composition des calculs urinaires. Elle repose sur la segmentation des images d'un scanner préopératoire standard et la sélection des régions les plus homogènes du calcul à l'aide d'un indice de dissimilarité. Par une approche bayesienne, nous déterminons la composition de 95 calculs in vitro et de 44 calculs in vivo en se basant sur la densité des voxels. Les sensibilités et spécificités in vivo sont les suivantes : acide urique (87,5%; 80,6%), cystine (100%; 94,4%), calculs calciques (67,9%; 93,8%). Nous démontrons in vitro que la mesure de densité par segmentation des calculs est plus précise que par l'utilisation d'une région d'intérêt (ROI), méthode utilisée de façon habituelle dans la littérature. Nous démontrons in vitro que la réalisation de protocoles scanner low dose ne dégrade pas les performances. Les performances sont similaires à celles des études récentes qui nécessitent, elles, une intervention humaine pour le traitement des données.ST QUENTIN EN YVELINES-BU (782972101) / SudocSudocFranceF

Intérêt du guidage 3D et de la localisation des biopsies de prostate par voie endorectale

International audienceLa réalisation de biopsies de prostate, le plus souvent par voie endorectale, est primordiale pour le diagnostic et l'évaluation du pronostic du cancer. La précision de la localisation des biopsies est sujette à caution. Le développement de systèmes informatiques permet d'enregistrer avec précision leur localisation et de les guider pour améliorer leur distribution. Ces mêmes dispositifs permettent de fusionner images échographiques et images IRM et de fusionner différentes séries de biopsies. L'ensemble de ces données pourrait être transféré dans les systèmes échographiques de type HIFU dans le but de rendre les protocoles de traitements focalisés plus précis

Intérêt du guidage 3D et de la localisation des biopsies de prostate par voie endorectale

International audienceLa réalisation de biopsies de prostate, le plus souvent par voie endorectale, est primordiale pour le diagnostic et l'évaluation du pronostic du cancer. La précision de la localisation des biopsies est sujette à caution. Le développement de systèmes informatiques permet d'enregistrer avec précision leur localisation et de les guider pour améliorer leur distribution. Ces mêmes dispositifs permettent de fusionner images échographiques et images IRM et de fusionner différentes séries de biopsies. L'ensemble de ces données pourrait être transféré dans les systèmes échographiques de type HIFU dans le but de rendre les protocoles de traitements focalisés plus précis

Biopsym : a learning environment for transrectal ultrasound guided prostate biopsies

International audienceThis paper describes a learning environment for image-guided prostate biopsies in cancer diagnosis; it is based on an ultrasound probe simulator virtually exploring real datasets obtained from patients. The aim is to make the training of young physicians easier and faster with a tool that combines lectures, biopsy simulations and recommended exercises to master this medical gesture. It will particularly help acquiring the three-dimensional representation of the prostate needed for practicing biopsy sequences. The simulator uses a haptic feedback to compute the position of the virtual probe from three-dimensional (3D) ultrasound recorded data. This paper presents the current version of this learning environment

Trus prostate biopsies pierced area can impact cancer rate detection

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